菌種鑒定是什么
發(fā)布時間：2021-03-18
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一、菌種鑒定目的
通過形態(tài)特征、理化特性、遺傳進(jìn)化角度等闡明微生物種群之間的分類學(xué)關(guān)系，確認(rèn)菌種的身份。
二、菌種鑒定方法
菌種鑒定一般就只要提取基因組DNA，然后PCR擴(kuò)增16s rDNA片段，上機(jī)測序之后，上GeneBank或者Eztaxon對比即可。一般序列相似度在99%以上就可以認(rèn)為是同一個種細(xì)菌。
三、DNA測序流程
（1）基因組DNA提取和檢測
（2）16SrDNA/18SrDNA擴(kuò)增
（3）產(chǎn)物純化，上機(jī)測序，序列比對分析
四、菌種鑒定報告(樣本)
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